Analítica avanzada con PySpark

Índice

Símbolos

• Codificación 1-de-N(ver codificación 1-hot)
• Proyecto 1000 Genomas, Análisis de Datos Genómicos y Proyecto BDG
• Visualización 3D de clusters, Visualización con SparkR
• "Representaciones de objetos 3D para una categorización detallada" (Krause, Stark, Deng y Fei-Fei), Preparación de los datos

A

• métrica de evaluación de la precisión, Nuestro primer árbol de decisión
• acciones para cálculos distribuidos, Configurar nuestros datos
  • métodos de caché y persistencia, Construir un primer modelo
• Biblioteca ADAM
  • sobre, Análisis de Datos Genómicos y el Proyecto BDG, Configuración de ADAM
    • Kit de Herramientas para el Análisis Genómico, Análisis de los Datos Genómicos y el Proyecto BDG, Hacia dónde ir a partir de aquí
  • acciones, Configurar ADAM
  • análisis de datos genómicos, Introducción al trabajo con datos genómicos mediante ADAM-Ingesta dedatos genómicos mediante PySpark y ADAM
    • análisis manual de falsos positivos, Ingesta de datos genómicos con PySpark y ADAM
    • conversión de formatos de archivo, Conversión de formatos de archivo con la CLI de ADAM
    • análisis de variantes genéticas, Ingesta de datos genómicos con PySpark y ADAM
    • Ingesta dedatos mediante PySpark, Ingesta de datosgenómicos mediante PySpark y ADAM-Ingesta dedatos genómicos mediante PySpark y ADAM
  • Formato de almacenamiento de datos Parquet, Ingesta de datos genómicos utilizando PySpark y ADAM
    • Conversión de formatos de archivo ADAM, Conversión de formatos de archivo con la CLI de ADAM
    • Uso del proyecto ADAM, Ingesta de datos genómicos con PySpark ...