Bioinformatik Datenkenntnisse

Glossar

Ausrichtung

(1) Der Prozess der Zuordnung einer Sequenz wie DNA, Protein oder RNA zu einer anderen Sequenz, die verwendet werden kann, um auf evolutionäre Beziehungen (z. B. Homologie) oder den Ursprung der Sequenz (z. B. ein Sequenzleseergebnis, das auf eine bestimmte Region eines Chromosoms ausgerichtet ist) zu schließen. (2) Ein einzelnes ausgerichtetes Sequenzpaar.

Allel

Eine alternative Form eines Gens an einem bestimmten Locus. Der SNP rs17822931 hat zum Beispiel zwei mögliche Allele (C und T), die die Art des Ohrenschmalzes bestimmen. Personen mit einem C-Allel (d.h. ihr Genotyp ist entweder CC oder CT) haben feuchtes Ohrenschmalz, während Personen mit zwei T-Allelen (d.h. ihr Genotyp ist TT) trockenes Ohrenschmalz haben.

UND

AND ist ein logischer Operator, der häufig in Programmiersprachen verwendet wird. x AND y hat den Wert true, wenn x und y beide wahr sind. In Python ist der logische UND-Operator and; in R ist er entweder && (für UND auf einen ganzen Vektor) oder & (für elementweises UND).

anonyme Funktion

Eine temporäre Funktion (die nur einmal verwendet wird) ohne Namen. Anonyme Funktionen werden häufig in R verwendet sapply() oder lapply() Auch Python unterstützt anonyme Funktionen durch seine lambda Ausdrücke (z. B.lambda x: 2*x).

Anwendungsprogrammierschnittstelle (API)

Eine API oder Anwendungsprogrammierschnittstelle ist eine definierte Schnittstelle zu einer Softwarekomponente, z. B. einer Datenbank oder einem Dateiformat (z. B. SAM/BAM-Dateien). ...