Genomik in der Cloud

Kapitel 13. Deinen eigenen Arbeitsbereich in Terra zusammenstellen

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In den Kapiteln 11 und 12 hast du gelernt, wie du Workflows und interaktive Notizbücher in Terra mit vorgefertigten Arbeitsbereichen nutzen kannst. Jetzt ist es an der Zeit, dass du lernst, deine eigenen Workspaces zu erstellen, damit du deine eigenen Analysen innerhalb des Terra-Frameworks erstellen kannst. In diesem Bereich gibt es viele Möglichkeiten und mehrere gültige Ansätze. Anstatt also zu versuchen, einen einheitlichen Weg zu finden, werden wir drei Szenarien durchgehen.

Im ersten Szenario erstellen wir den Arbeitsbereich des Buchtutorials aus seinen Basiskomponenten neu, um die wichtigsten Mechanismen zu veranschaulichen, die beim Zusammenstellen eines Arbeitsbereichs von Grund auf eine Rolle spielen. Im zweiten und dritten Szenario zeigen wir dir, wie du die Vorteile bestehender Arbeitsbereiche nutzen kannst, um den Arbeitsaufwand zu minimieren, wenn du ein neues Projekt beginnst. In einem Fall erklären wir, wie du Daten zu einem bestehenden Arbeitsbereich hinzufügst, der bereits für eine bestimmte Analyse eingerichtet ist, wie z. B. die offiziellen GATK Best Practices Arbeitsbereiche. Im anderen Fall zeigen wir, wie man eine Analyse mit Daten erstellt, die aus der Terra Data Library exportiert wurden. Bevor wir uns mit diesen drei Szenarien befassen, wollen wir uns die ...