Java für die Life Sciences

KAPITEL 6

Bildverarbeitung mit Java und ImageJ

Bildverarbeitung und -optimierung sind essenzielle Bestandteile der Lebenswissenschaften. Diverse Geräte und Assays, seien es Mikroskope, Fotokameras oder auch DNA-Sequenzierer, liefern als primäre Daten Bilder. Die eigentliche Zielinformation, wie z.B. Lichtmenge (Signalquantifizierung) oder Anzahl, Größe oder Form von Objekten, liegt dabei innerhalb der Bilder vor. Allein aufgrund der häufig hohen Zahl von Bildern (z.B. bei Mikroskopie-Screenings), vor allem aber bedingt durch die Art der Bildinhalte, eignen sich Algorithmen hervorragend für die objektive Auswertung solcher Daten. Während nur sehr selten die viel zitierte Katze in Suchbildern zu identifizieren ist, geht es in den Lebenswissenschaften ...