Expressionsdaten laden
Im vorliegenden Fall können wir mogeln: Wir arbeiten in diesem Beispiel mit einem
Datensatz, der über die GEO-Datenbank bereitgestellt wird. Bereits vorverarbeitete und
aufbereitete Expressionsdaten lassen sich mit der Funktion getGEO() aus dem Bioconductor-Paket GEOquery direkt über das Internet in die R-Sitzung laden. Mit Daten, die
nicht in GEO archiviert sind, würde das selbstverständlich nicht funktionieren, aber so
haben wir es einfacher:
> library(GEOquery) Lade nötiges Paket: Biobase Welcome to Bioconductor Vignettes contain introductory material. To view, type 'openVignette()'. To cite Bioconductor, see 'citation("Biobase")' and for packages 'citation(pkgname)'. Lade nötiges Paket: RCurl Lade nötiges Paket: bitops ...Get R in a Nutshell now with the O’Reilly learning platform.
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