Genomik in der Cloud

Glossar

ADC

Application Default Credentials - eine Authentifizierungsmethode

AI

Künstliche Intelligenz - ein Teilbereich des maschinellen Lernens

API

Anwendungsprogrammierschnittstelle

ASHG

Amerikanische Gesellschaft für Humangenetik - eine Fachgesellschaft

ASIC

anwendungsspezifischer integrierter Schaltkreis

AWS

Amazon Web Services

BAM

Binary Alignment Map - ein Sequenzdatenformat (binär komprimierte Version von SAM)

BCL

Basecall - ein Sequenzdatenformat

BQSR

Base Quality Score Rekalibrierung - eine Datenverarbeitungstechnik, die technische Verzerrungen bei der Probenvorbereitung und den Sequenzierungsprozessen berücksichtigt

CIGAR

Concise Idiosyncratic Gapped Alignment Report - beschreibt die Ausrichtung einer gelesenen Sequenz an der Genomreferenz

CLI

Befehlszeilenschnittstelle

CNA

Kopienzahlveränderung - eine Art von Genomvariation, die aus einer Veränderung der Anzahl der Kopien des betroffenen DNA-Abschnitts besteht

CNN

Faltungsneuronales Netzwerk - eine Art von maschinellem Lernalgorithmus

Kontig

Im ursprünglichen Kontext der Genomassemblierung ein Satz sich überlappender DNA-Segmente, die zusammen eine Konsensregion der DNA darstellen; kann sich im weiteren Sinne auf ein Chromosom oder eine andere freistehende Darstellung der DNA beziehen, wie z. B. ein teilweise assembliertes Segment eines Chromosoms, ein Plasmid oder ein Virusgenom (von contiguous)

CPU

zentrale verarbeitungseinheit

CRAM

ein Sequenzdatenformat (ähnlich wie BAM; eine weitere komprimierte Version von ...