Java für die Life Sciences

KAPITEL 7

Sequenzanalyse mit BioJava

Länger schon als die Prägung des Begriffs »Bioinformatik« selbst steht die Arbeit an der Schnittstelle zwischen Biologie und Informatik in der ersten Assoziation im Kontext genomischer Daten. Sind viele datenbasierte Aufgabenstellungen noch von anderen Disziplinen wie der Statistik unterstützt oder übernommen worden, so wurde die Erzeugung, Speicherung und Analyse von DNA-Sequenzdaten bald zu einem eigenständigen interdisziplinären Fachgebiet. Nicht zuletzt das »Rennen« um das erste menschliche Referenzgenom, offen behandelt sogar in den Medien abseits von Fachmagazinen, hat die Bioinformatik vermeintlich als sequenzverarbeitenden Aufgabenkomplex in das öffentliche Bewusstsein gerückt. Das ist, wie wir auch ...