Wichtige Bioconductor-Pakete

Das Bioconductor-Repository besteht zurzeit aus fast 400 Softwarepaketen für die Arbeit mit genetischen Daten, dazu kommen mehr als 400 Annotationspakete. In der folgenden Tabelle sind einige besonders wichtige oder beliebte Pakete inklusive einer kurzen Beschreibung der enthaltenen Klassen und Funktionen zusammengestellt.

Kategorie

Paket

Beschreibung

Allgemeine, Basis-und Hilfsfunktionen

Biobase

Basispaket mit standardisierten S4-Datenstrukturen und -Methoden zum Umgang mit Gen- und Genomdaten – das Fundament des Bioconductor-Frameworks.

 

Biostrings

Datencontainer zur effizienten Speicherung von text- bzw. stringbasierten Daten, Algorithmen zum Textvergleich und zur Textmanipulation sowie weitere Werkzeuge zur Verarbeitung ...

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