October 2024
Intermediate to advanced
456 pages
11h 48m
German
Content preview from Python für die Bioinformatik beherrschen
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O’Reilly covers everything we've got, with content to help us build a world-class technology community, upgrade the capabilities and competencies of our teams, and improve overall team performance as well as their engagement.I wanted to learn C and C++, but it didn't click for me until I picked up an O'Reilly book. When I went on the O’Reilly platform, I was astonished to find all the books there, plus live events and sandboxes so you could play around with the technology.I’ve been on the O’Reilly platform for more than eight years. I use a couple of learning platforms, but I'm on O'Reilly more than anybody else. When you're there, you start learning. I'm never disappointed.I'm always learning. So when I got on to O'Reilly, I was like a kid in a candy store. There are playlists. There are answers. There's on-demand training. It's worth its weight in gold, in terms of what it allows me to do.
Kapitel 1. Tetranukleotid-Frequenz: Das Zählen der Dinge
Diese Arbeit wurde mithilfe von KI übersetzt. Wir freuen uns über dein Feedback und deine Kommentare: translation-feedback@oreilly.com
Das Zählen der Basen in der DNA ist vielleicht das "Hallo, Welt!" der Bioinformatik. Die Rosalind-DNA-Herausforderung beschreibt ein Programm, das aus einer DNA-Sequenz die Anzahl der gefundenen As, Cs, Gsund Tsausgibt. Es gibt überraschend viele Möglichkeiten, Dinge in Python zu zählen, und ich werde erkunden, was die Sprache zu bieten hat. Ich werde auch zeigen, wie man ein gut strukturiertes, dokumentiertes Programm schreibt, das seine Argumente validiert, und wie man Tests schreibt und ausführt, um sicherzustellen, dass das Programm richtig funktioniert.
In diesem Kapitel erfährst du:
-
So starten Sie ein neues Programm mit
new.py -
So definieren und validieren Sie Befehlszeilenargumente mit
argparse -
So führen Sie eine Testsuite mit
pytest -
Wie man die Zeichen einer Zeichenkette iteriert
-
Möglichkeiten zum Zählen von Elementen in einer Sammlung
-
Wie man einen Entscheidungsbaum mit
if/elifAnweisungen erstellt -
Wie man Strings formatiert
Erste Schritte
Bevor du beginnst, solltest du den Abschnitt "Getting the Code and Tests" im Vorwort gelesen haben. Sobald du eine lokale Kopie des Code-Repositorys hast, wechsle in das Verzeichnis 01_dna:
$ cd 01_dna
Hier findest du mehrere solution*.py Programme zusammen mit Tests und Eingabedaten, mit denen du überprüfen kannst, ob die Programme ...
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O’Reilly covers everything we've got, with content to help us build a world-class technology community, upgrade the capabilities and competencies of our teams, and improve overall team performance as well as their engagement.Julian F.
I wanted to learn C and C++, but it didn't click for me until I picked up an O'Reilly book. When I went on the O’Reilly platform, I was astonished to find all the books there, plus live events and sandboxes so you could play around with the technology.Addison B.
I’ve been on the O’Reilly platform for more than eight years. I use a couple of learning platforms, but I'm on O'Reilly more than anybody else. When you're there, you start learning. I'm never disappointed.Amir M.
I'm always learning. So when I got on to O'Reilly, I was like a kid in a candy store. There are playlists. There are answers. There's on-demand training. It's worth its weight in gold, in terms of what it allows me to do.