Rグラフィックスクックブック 第2版 ―ggplot2によるグラフ作成のレシピ集

レシピ

13.11

 樹形図を作成する

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出力ファイルは一時ディレクトリに保存され、ディレクトリの名前が

R

コンソールに表示されま

す。

.gif

ファイルの出力に

ImageMagick

を使いたくない場合には、

convert=FALSE

と指定して、一連

の

.png

ファイルを他のソフトウェアを使って動画にすることもできます。

レシピ

13.11

 樹形図を作成する

問題

要素のクラスター分析結果を示す樹形図を作成したい。

解決策

hclust()

を使用し、その出力をプロットします。その前に、データの前処理が必要になります。今

回の例では、まず

countries

データセットから

2009

年の一部分のデータを取り出します。また、簡単

のために

NA

を含む行をすべて除き、残った行からランダムに

25

行を選びます。

library(dplyr)

library(tidyr) # drop_na

関数を使用するため

library(gcookbook) #

データセットを使用するため

#

再現性のためにランダムシードを設定する

set.seed(392)

c2 <- countries %>%

filter(Year == 2009) %>% # 2009

年のデータを取得

drop_na() %>% # NA

値を持つ行は削除する

sample_n(25) # 25

個のランダムな行を取得する

c2

#> Name Code Year GDP laborrate healthexp infmortality

#> 111 Liberia LBR ...