Chapitre 3. Complément inverse de l'ADN : Manipulation des cordes
Cet ouvrage a été traduit à l'aide de l'IA. Tes réactions et tes commentaires sont les bienvenus : translation-feedback@oreilly.com
Le défi Rosalind REVC explique que les bases de l'ADN forment des paires A-T et G-C. De plus, l'ADN a une direction et est généralement lu de l'extrémité 5'-(extrémité à cinq amorces) vers l'extrémité 3'-(extrémité à trois amorces).Comme le montre la figure 3-1, le complément de la chaîne d'ADN AAAACCCGGT est TTTTGGGCCA.J'inverse ensuite cette chaîne (en lisant à partir de l'extrémité 3'-) pour obtenir ACCGGGTTTT en tant que complément inverse.
Figure 3-1. Le complément inverse de l'ADN est le complément lu dans la direction opposée
Bien que tu puisses trouver de nombreux outils existants pour générer le complément inverse de l'ADN - et je vais lâcher une alerte spoiler en disant que la solution finale utilisera une fonction de la bibliothèque Biopython - l'intérêt d'écrire notre propre algorithme est d'explorer Python. Dans ce chapitre, tu apprendras :
Comment mettre en place un arbre de décision en utilisant un dictionnaire comme table de consultation ?
Comment générer dynamiquement une liste ou une chaîne de caractères ?
Comment utiliser la fonction reversed(), qui est un exemple d'itérateur ?
Comment Python traite les chaînes de caractères et les listes de manière similaire. ...
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