Kapitel 3. Umgekehrte Komplementierung der DNA: String-Manipulation
Diese Arbeit wurde mithilfe von KI übersetzt. Wir freuen uns über dein Feedback und deine Kommentare: translation-feedback@oreilly.com
Die Rosalind REVC-Herausforderung erklärt, dass die Basen der DNA Paare von A-T und G-C bilden. Außerdem hat die DNA eine Richtungsabhängigkeit und wird normalerweise vom 5'-Ende(Ende mit fünf Basen) zum 3'-Ende(Ende mit drei Basen) hin gelesen.Wie in Abbildung 3-1 gezeigt, ist das Komplement der DNA-Kette AAAACCCGGTTTTTGGGCCA.Ich lese diese Kette dann umgekehrt (vom 3'-Ende aus) und erhalte ACCGGGTTTT als umgekehrtes Komplement.
Abbildung 3-1. Das umgekehrte Komplement der DNA ist das Komplement, das aus der entgegengesetzten Richtung gelesen wird
Obwohl es viele Tools gibt, mit denen du das umgekehrte Komplement der DNA generieren kannst - und ich werde einen Spoiler-Alarm auslösen, dass die endgültige Lösung eine Funktion aus der Biopython-Bibliothek verwenden wird - geht es beim Schreiben unseres eigenen Algorithmus darum, Python zu erforschen. In diesem Kapitel wirst du lernen:
Wie man einen Entscheidungsbaum mit einem Wörterbuch als Nachschlagetabelle implementiert
Wie man eine Liste oder einen String dynamisch erzeugt
Wie man die Funktion reversed() verwendet, die ein Beispiel für einen Iterator ist
Wie Python Zeichenketten und Listen ähnlich behandelt
Wie man ...
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