バイオビルダー ―合成生物学をはじめよう

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似ていると考えることができます。この配線図は電

気工学の形式であり、合成生物学で各システムの設

計要素を伝えるために採用されたものです。この章

の後半で、配線図の書き方と解釈の仕方を見ていき

ます。

設計から実装へ

 上出来な設計が、最終的に実装されていくことに

なります。この章では合成生物学の設計部分に焦点

を当てていますが、それがどのように実装の段階に

適用されるのかを示すために、バックパッキングの

例えを少し拡張してみるのも無駄ではないはずです。

 バックパッキングの計画では、非常に広い仕様から始めて、最も低い抽象化レベル

である装備リストに掘り下げていきました。これはただのリストであって、実際のア

イテム自体ではない点に注意してください。リスト上の項目から実際の具体的な物へ

と移行することは、デザインプロセスの最終段階から実装に向かう最初の段階への移

行を示しています。あなたの設計

（すなわちあなたの旅行）

を実装するためには、出発して

計画した休暇を楽しむまで、この低いレベルから再構築することになります。それを

するためには、装備リスト上のアイテムを集めるのです。たぶん、地元のアウトドア

ショップで買ったり、家の地下にある収納ケースから掘り出したりすることになりま

す。そして、すべての道具をそろえたらバックに詰めて道程の出発地点に向かい、あ

なたの旅行を始めるのです。

 合成生物学のデザインにとって、

DNA

断片は、設計を実装するのに必要となる「装

備品」です。この

DNA

の物理的断片は、遺伝子、プロモーター、ターミネーター、 ...