バイオビルダー ―合成生物学をはじめよう

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ある

S-gal

の量が制限されていれば、この変化は限られた時間内に生成される色の量

を増加させます。

 

TinkerCell

は、モデルの構成要素についてたくさんの仮定をしますが、これらのパ

ラメーターを調整することで、システムがどのように応答するのかを探究することが

できます。このようなシミュレーション実験は、ウェットラボで行うものよりも時間

がかからないことがわかるでしょう。そのため、モデルがうまく設定されれば、実験

台に向かう時間を大幅に節約することができ、賢明なアプローチを取りながら実験が

できるはずです。

電子回路のモデリング

 

Picture This

の物理モデリングでは、「細菌写真の菌株の電子回路版を構築します」。

章の最初で出した建築の例を思い出してください。コンピューター支援設計ツールは、

建築家が広範囲にわたる環境条件下での設計の評価やテストを助けました。また建築

家は、設計を構想し、必要なのに欠落している構成要素を特定するのに役立つモデリ

ングの補完として物理モデルを作ることもできます。合成生物学者にとって、細胞の

物理モデルはそれほど多くの追加情報をもたらさないかもしれませんが、遺伝子回路

を通る情報の流れを示すような物理モデルは参考になり、それを使って回路の試験的

な予測を行うことができるはずです。遺伝子回路がより複雑になるにつれ、回路を通

る情報の流れをモデリングすることは、非常に困難となりえます。しかし、細菌写真

システムは、非常に単純な論理でできているので、図

8-13

で示されているように、生

物学的な要素の「代役」として電子部品を使用した物理モデルの価値を説明するため

に使うことができます。

 この章の「さらに詳しく学びたい人のために」

（

P.161

）

で、

Mouser Electr ...