バイオビルダー ―合成生物学をはじめよう

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バイオビ ルダ ー

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2

章

バイオ デ ザイン の 基 礎

トピックの 領 域

システム

デ バイス

パーツ

DNA

択されました。アプローチを実装するための仕様のいくつかは整ってきましたが、詳

細についてはまだ掘り下げていません。それは次にしましょう！

デ バ イス 、パ ー ツ 、DNAを使ったシステムの特定

 高いレベルのシステムデザインが整理されたら、それがどのように機能するのかを

特定し、実装のための詳細を掘り下げ始める時がきました。しかし、いきなり遺伝子

に取りかかるよりはむしろ、抽象化の各ステップを段階的に進んでいきましょう。

 前のステップでは、さまざまな刺激や環境条件に対してシステムがいかに応答すべき

かを示す広範な記述を作成しました。そのようなシステムを構築するためには、

DNA

レベルまで降りて、「シャーシ」

（遺伝子プログラムを実行するための生き物を指す用語）

を決

める必要があります。システムの仕様に役立つものとして、抽象化レベルの

2

つの中

間階層、デバイスとパーツがあり、図

2-3

のようになっています。

 ひとつ以上のパーツからなるデバイスは、指定できる「インプット」

（入力）

を検出可

能な「アウトプット」

（出力）

に変換したり、そのアウトプットを他のデバイスに送っ

たりすることができます。ヒ素検出の例で

iGEM

チームは、ヒ素を検出する方法と、そ

れに応答して色を生成する方法が必要なことを知っていました。チームはひとつのデ

バイス、すなわちヒ素を検出して色を生成するもので、そのシステムを実装すること ...