バイオビルダー ―合成生物学をはじめよう

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を使うのかといった選択は、いくつかの事柄に依存します。時々、化学的外部イ

ンプットにも制御される（あるいはされない）インバーターが望まれます。例えば、

イソプロピルβ

-D-1-

チオガラクトピラノシド（

IPTG

）と呼ばれるラクトースの

アナログ（類似体）は、

lac

リプレッサータンパク質の抑制を解除するために使

うことができます。このように、仮にインバーターがそのタンパク質と一緒に作

られたとしても、培地中に

IPTG

を加えることで論理を切り替えることができます。

インバーターの選択は、すでにシステムに組み込まれている他のものに依存する

こともあります。例えば、あなたが仮に構築している細胞で他の遺伝子のタスク

を実行するために

lac

リプレッサーをすでに使っていたとすると、インバーター

の機能として他にも使うことは、お粗末な選択かもしれません。最後に、すべて

のインバーターはインプット／アウトプットの論理を反転させるのですが、それ

ぞれ異なるキネティクス（より早く／遅く）と、異なる効率（定常状態で

80

％

オフ

vs.95

％オフ）で機能することでしょう。これらは、あなたのデザインに関

連する検討事項かもしれません。標準生物学的パーツ・レジストリは、異なる条

件下での異なるインバーターの振る舞いの特徴を明らかにしようとしましたが、

インバーターによって作られる可能性のあるシステムの数の多さを考えると、選

んだインバーターが問題となっているシステムに対してうまく機能するかどうか

を合成生物学者が識別できるようになるまでには、 ...