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バイオビ ルダ ー
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8
章
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実験演習
Picture This 実験演習
BioBuilder
の
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実験演習では、改変された二成分センシング系の分析を通
して、シグナル伝達や細胞動態といった複雑な生物学の概念を紹介します。ここには
操作された細胞のコンピューターシミュレーションと細胞の遺伝子回路に似た電子回
路を組むことを通して、抽象化とモデリングという工学の概念に重きを置いています。
デ ザ インの 選 択
ここでは、
TinkerCell
(ティンカーセル)
というプログラムを使ったコンピューターモ
デリングと、標準的な電子部品を使った物理モデリングという
2
つのアプローチを使っ
て、細菌写真システムを理解していきます。
BioBuilder
の他の実験演習とは対照的に、
この演習では、実験の疑問を直接問うよりはむしろ、その疑問を発展させることに焦
点を当てています。
2
つの相補的なモデリングアプローチは、生物システムの振る舞
いのさまざまな側面への洞察を与え、生物をモデリングする現在の試みの強みと弱み
を示してくれます。
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実験演習に「ウェットラボ」の要素は今のところありませんが、サポー
トしてくれる機関の協力を得ることで、あなたが選んだ画像を使い、遺伝子操作され
た菌株で細菌写真を現像してもらうことができるでしょう。
BioBuilder
のウェブサイ
トでこの実験演習の最新情報と、データ投稿のガイドラインを確認してください。細
菌写真を現像するプロトコルは、次の項で簡単に説明されています。